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內氏放線菌PCR檢測試劑盒使用方法

點擊次數:1079 更新時間:2020-03-19

內氏放線菌PCR檢測試劑盒使用方法 :   

1 實驗所需器材與試劑

1.1 器材

1)PCR儀

2)PCR反應管

3)電泳儀及水平電泳槽

4)高速離心機

5)微量移液器及移液器吸頭

1.2 試劑

1)瓊脂糖

2)EB(溴化乙錠)

3)去離子水或雙蒸水

 

反應五要素:

參加PCR反應的物質主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+

引物:引物是PCR特異性反應的關鍵,PCR 產物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增。設計引物應遵循以下原則:

①引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。

②引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。

③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC*隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

④避免引物內部出現二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產生非特異的擴增條帶。

⑤引物3'端的堿基,特別是末及倒數第二個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。

⑥引物中有或能加上合適的酶切位點, 被擴增的靶序列*有適宜的酶切位點, 這對酶切分析或分子克隆很有好處。

⑦引物的特異性:引物應與核酸序列數據庫的其它序列無明顯同源性。

引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以*引物量產生所需要的結果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會。

注意事項:   

5.1使用本試劑前請仔細閱讀本說明書全文。

5.2 操作時應盡量少說話,因口腔中也含有支原體,可能引起樣品污染,而造成假陽性;整個檢測過程中,反應體系的配制、樣本處理及加樣、PCR擴增應分區(qū)域進行,以避免交叉污染。 5.3 實驗時,試劑盒組分中的試劑使用前應充分融化并混勻(混勻時禁止激烈振蕩,只需要進行上下倒置多次進行混勻)。

5.4 反應管中加好所有的試劑后,應盡快上PCR儀進行擴增,以免形成過多的二聚體。

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